其实，人工流产手术最常见的并发症就是术后感染。平时，阴道内有许多细菌存在，宫颈管的下1/ 3段也有细菌生长。但因为有宫颈粘液栓填塞在宫颈管内，将子宫腔与阴道分隔开来，使这些细菌不能轻而易举地进入宫腔。在行人工流产术时，手术器械需要经过阴道、宫颈进入宫腔，虽然遵循严格的手术操作规定，手术器械并不触碰阴道壁，但手术中扩张了宫颈管及宫颈内口，为细菌的上行感染提供了机会；况且细菌还有可能随手术器械直接进入宫腔。这就是人工流产手术后可能发生感染的原因。
　　
　　我们知道，阴道内有许多细菌生长，菌群间平时处于共生状态，相互抑制，不会致病。而发生阴道炎时，这些细菌菌群间的平衡关系被打破，某些细菌过度生长，处于致病状态。如果此时不经治疗即行人工流产手术，那么致病菌进入宫腔的机会就会增加，从而使术后感染更容易发生。 　
　
　　因此，人工流产手术前常规做妇科检查和阴道分泌物化验，其目的之一就是要及时发现潜在的能引起术后感染的疾病，并给予治疗，以保证手术及术后的安全。这也是医生们一直建议不要在小诊所里悄悄“流走”的原因之一。